Tđịnh dạng tệp .jam không lưu trữ bất kỳ lựa chọn tùy chọn lập trình nào đã được bật trong Quartus® Cửa sổ Lập trình II. Trong cửa sổ Quartus II Programmer, các tùy chọn lập trình sẽ bị bỏ qua khi tạo tệp .jam. Do đó, tệp .jam không có khả năng cho phép người dùng chọn các tùy chọn như chương trình, xác minh, kiểm tra trống hoặc xóa trên các thiết bị riêng lẻ.
Khi thực hiện tệp .jam thông qua Jam STAPL Player, bạn có thể chọn thao tác phù hợp. Tuy nhiên, nếu đây là tệp .jam đa thiết bị, thao tác bạn chọn sẽ áp dụng cho tất cả các thiết bị trong chuỗi JTAG vì có một tệp dữ liệu cho mỗi thiết bị trong tệp .jam đa thiết bị.