Phần mềm Quartus® II sẽ cố tình ngăn bạn kết nối một đồng hồ đã được thu hồi từ máy thu đến đầu vào đồng hồ tham chiếu của PLL máy phát.
Đồng hồ đã phục hồi được trích xuất từ đồng hồ được nhúng trong luồng dữ liệu nhận được. Khi luồng dữ liệu đã lan truyền trên một kênh, đồng hồ bị thu hồi sẽ có các đặc tính jitter không xác định, nếu được đưa vào đồng hồ tham chiếu của PLL máy phát, có thể gây ra sự jitter truyền vượt quá thông số kỹ thuật jitter truyền của các giao thức nhất định.
Phương pháp được đề xuất để triển khai kiến trúc đồng bộ đồng bộ đồng hồ đã phục hồi là định tuyến đồng hồ đã được thu hồi bên ngoài FPGA và để truyền đồng hồ qua bộ dọn dẹp bị jitter trước khi quay trở lại FPGA thông qua một trong các chân đồng hồ tham chiếu bộ thu phát chuyên dụng.